
Anthropic宣布,其AI模型Claude在噬菌体DNA中发现了一种此前未被描述的酶系统。在该酶基因旁,存在一段结构与CRISPR阵列相似的长串重复DNA。目前,该公司尚不清楚该系统的具体功能。
Anthropic通过博客文章和未经同行评审的预印本公布了这一结果。这是该公司新成立的分子生物学小组及实验室的首个研究成果。团队将该系统命名为“阵列相关逆转录酶”(Array-Associated Reverse Transcriptases,简称ART)。
Claude的发现
逆转录酶是一种能将RNA复制为DNA的酶,细菌通常利用此类酶抵御病毒感染。ART系统由三部分组成:酶本身、旁边的伴侣基因,以及一组均匀分布的DNA重复序列。
这种布局让人联想到利用阵列存储不同RNA引导序列的CRISPR系统。预印本描述显示,ART阵列包含3到21个短重复序列拷贝。与CRISPR系统不同,ART附近并不携带cas基因。
实验室测试中,Anthropic科学家发现该阵列被读取为一组独特的短RNA。在一项关于金黄色葡萄球菌噬菌体的公开数据中,这些RNA在感染后15分钟内占到了噬菌体总RNA的8%。预印本指出,团队尚未证明该酶具有活性,也未证实它作用于这些RNA。
Anthropic表示,仅有少数已知系统具备这一特征组合,且所有这些系统都能切割、复制或粘贴DNA。
搜索过程
团队向Claude下达研究简报,要求在包含19亿个蛋白质簇的数据库中寻找新的逆转录酶系统。运行Claude Mythos 5的智能体完成了其余工作:一个智能体负责规划和执行任务,另一个进行审核,随着进程推进,智能体会不断开启新任务。
预印本记载,整个活动在没有人类干预的情况下持续了21.5小时,跨越949次智能体会话,处理了2.156亿个token。智能体回收了约20万个酶簇,评估了3,564个候选伴侣家族,并提交了19份供人类审查的报告。
ART的发现源于一次“侧路探索”。一个正在读取罕见酶旁原始DNA的智能体表示,它能“肉眼”看到重复模式。随后,它统计了重复次数,将其与已知系统进行比对,并检索文献,最后提交报告。
MIT和Broad研究所的CRISPR先驱张锋审阅了该预印本。Anthropic在帖子中发布了他的评论:“将逆转录酶与RNA重复阵列联系起来确实引人入胜,值得进一步调查。”
尚未明确的细节
酶本身并非全新发现。Anthropic表示,早期研究已识别出该酶,而Claude似乎是第一个注意到阵列和伴侣蛋白的工具。预印本指出,对一种ART噬菌体的首次基因组报道虽然描述了该酶,但未提及重复序列或伴侣基因。
这一发现也难以复现。Anthropic又进行了十次相同的实验活动,没有任何一次复现实验读取了酶上游的DNA,所有十次都错过了该阵列。作者将此归因于搜索范围的大小以及智能体行为的不可预测性。
在固定测试中,当Anthropic向其最强大的四个模型直接提供DNA时,它们在至少90%的尝试中描述了该阵列。但当使用文件和工具时,成功率降至32%。很多时候,模型未能读取足够的DNA以观察到完整的重复序列。
团队还深入研究了Mythos 5读取序列时的内部情况。在智能体命名重复序列之前,两个内部信号在重复序列处触发。Anthropic此前曾构建过用于研究Claude未言明思维的工具。
背后的实验室
Anthropic于2026年春季成立了该小组。公司表示,其在湾区的实验室仅在生物安全1级和2级水平下运作,不处理任何感染人类的病原体。所有实验室工作均由人类科学家完成。团队使用了Anthropic于6月推出的Claude Code和Claude Science。
该小组隶属于Anthropic的生命科学部门,该部门还从事药物研发工作。Anthropic今年4月以4亿美元收购了Coefficient Bio。同月,OpenAI推出了面向生命科学研究的模型GPT-Rosalind。
Anthropic表示,更多实验正在进行中,以确定ART的功能。他们正在邀请其他科学家提交研究提案。